Nghiên cứu này được thực hiện nhằm đánh giá đa dạng nguồn tài nguyên cây thuốc được cộng đồng dân tộc Khơ Mú sử dụng tại rừng Đặc dụng, Phòng hộ Sốp Cộp, tỉnh Sơn La. Bằng phương pháp nghiên cứu thực vật học truyền thống được thực hiện từ tháng 7/2019 đến tháng 3/2020. Kết quả thu được 389 loài cây thuốc thuộc 294 chi, 109 họ thuộc 4 ngành thực vật bậc cao có mạch. Có 10 họ có nhiều loài nhất. Các loài cây thuốc được dân tộc Khơ Mú sử dụng khác nhau để điều trị 18 nhóm bệnh, trong đó cây thuốc chữa bệnh về đường tiêu hoá chiếm tỷ lệ cao nhất về số loài là 102 loài (26,22%). Trong các bộ phận được sử dụng làm thuốc lá được sử dụng nhiều nhất chiếm 26,74%. Nơi phân bố cây thuốc ở các dạng sinh cảnh như: ở rừng, nương rẫy, ven đường, vườn nhà, thảm cây bụi, khe nước ẩm. Đã xác định được 28 loài thuốc (chiếm 7,19%) có nguy cơ bị đe dọa được ghi trong Sách đỏ Việt Nam (2007), có 18 loài được ghi trong Danh lục Đỏ cây thuốc Việt Nam, 2019 của Nguyễn Tập và 12 loài trong Nghị định 06/2019/NĐ-CP. Đây là những loài có số cá thể còn ít nên cần có những chính sách ưu tỉên bảo tồn và phát triển.